shotgun sekventering protokol

Shotgun sekventering er en tilgang til sekventering rækkefølgen af basepar i et genom . Det var en af de to tilgange til sekvensen af det menneskelige genom , den anden er de tre etaper er ansat af de føderalt finansierede Human Genome Project

funktioner

I shotgun sekventering , er mange kopier af et kromosom hakkede i mindre stykker ved hjælp af enzymer kaldet restriktionsenzymer , der gør nedskæringer i DNA . Disse mindre stykker er derefter klonet eller kopieres i bakterier og sekventeret .

Funktion

Nøglen til shotgun sekvenser er, at mange af de fragmenter indeholder overlappende sekvenser eller segmenter kaldet contigs ( kort for sammenhængende sekvenser ) . Når de fragmenter er blevet sekventeret, kan dataene samles på en computer at rekonstruere den oprindelige rækkefølge af hele kromosomet .

Overvejelser

Hele-genom shotgun sekventering metode er bedst egnet til mindre genomer af enklere organismer , der mangler genomer med mange gentagne sekvenser . Genomer med mange gentagne sekvenser er mere udfordrende , da computeren ikke kan være i stand til at tildele identiske sekvenser til den relevante placering . Ikke desto mindre har shotgun sekvensering blevet en meget anvendt metode til genomsekvensering .


Kommentarer

Vi ønsker, at dine argumenter og meninger er velkomne. Være objektiv og medfølelse. Mange mennesker læser hvad du skriver. Gør debat til en bedre oplevelse for både dem og dig selv. Mellem 20:00 og 08:00 det er lukket for kommentering og vi fjerner automatisk kommentarer med sjofle ord, defineret af vores moderatorer.

link:

  • Om os
  • Advertising
  • Fortæl redaktionen
  • Få nyhedsbreve
  • RSS-feed

Redaktør: Karin Christofferse
Nyheder redactor: Morten Nyberg

Kundeservice: Stig Ole Salomon,
Flemming Sørensen

Tel: +45 00 99 99 00
Fax: +45 00 99 99 01

© Copyright 2014 Einsten.net - All rights reserved.