SNP genotypebestemmelse metoder

Nye gennembrud inden for videnskab , såsom færdiggørelsen af det menneskelige genom -projektet , definere milepæle i biologi . Projektet blev gennemført i februar 2001 og givet ny viden , som en henvisning til hvilke muligheder , der giver en forskel i den enkelte. Til at bistå det humane genom -projekt , SNPs , eller enkelt- nucleotid polymorfier , blev identificeret til at skelne den unikke genetiske forskelle på de enkelte

MassARRAY Genotypebestemmelse

Den mest omkostningseffektive og højkvalitets SNP genotypebestemmelse , der kan tilpasses den MassARRAY genotypebestemmelse . Dette udnytter Sequenom MassARRAY genotypebestemmelse system , som har været brugt i mange år . Processen indebærer en enkelt godt , hvor en metode til multiplex PCR ( polymerase chain reaction ) samt en mini-sekventering reaktion finder sted. Resultatet i sidste ende giver genotypen oplysninger , der kommer fra en MALDI- TOF ( matrix assisteret laser desorption ionisering-time of flight ) massespektrometri bestemmes af størrelsen af reaktionen . Alle de metoder, der er involveret i denne skrive er meget automatiserede og spores med stregkodning .

Illumina Infinium Indhold

En anden metode til genotypebestemmelse hele genomer er Illumina Infinium Assay ( eller Illumina Infinium Analysis) , hvori hundredtusinder af SNPs er genotypebestemmes bruger Infinium II assays . En hel-genom forstærkning system bruges til at udvide antallet af DNA op til et tusinde , hvori fragmenter er fanget på en BeadArray gennem hybridisering . Efter dette, er de SNPs udvides til en enkelt nucleotid og gennemgå farvning . Analyser af SNPs er færdig ved at scanne arrays og scorede det genotype .

Sequenom HME Genotypebestemmelse

Denne teknik er blevet brugt til større skala tilpasset genotypebestemmelse . Forskere bruger denne genotypebestemmelse metode med projekter , der har lavere SNP numre-et til 20 SNPs . Den Multiplex SNP analyse er mest gunstigt stillede områder og er udført med syv SNPs , hvilket er det maksimale antal pr Plex.

Sequenom iPLEX Genotypebestemmelse

Genotypebestemmelse på op til 29 brugerdefinerede SNPs kan analyseres ved hjælp af Sequenom iPLEX software og kemi . Dette er en yderligere analyseres ved hjælp af en nominel genomisk DNA udføres ved hjælp af en brønd . Platformen kan ske i projekter, der involverer 20 til 300 SNPs . I 2007 kørte forskere groft 2. 500 forskellige SNP -analyser med en observeret 95 procent omstilling til analyse , hvori 89 procent var i den fase, 20 plekst eller længere .

Illumina Golden Gate Genotypebestemmelse

Denne metode genotypebestemmelse anvendes i studere store genotyper og udføres ved hjælp af 384 til 1. 536 SNPs generelt opdelt i multipla af 96 SNPs . Dette bruges med brugerdefinerede Illumina SNP paneler eller standard validerede præfabrikerede paneler .


Kommentarer

Vi ønsker, at dine argumenter og meninger er velkomne. Være objektiv og medfølelse. Mange mennesker læser hvad du skriver. Gør debat til en bedre oplevelse for både dem og dig selv. Mellem 20:00 og 08:00 det er lukket for kommentering og vi fjerner automatisk kommentarer med sjofle ord, defineret af vores moderatorer.

link:

  • Om os
  • Advertising
  • Fortæl redaktionen
  • Få nyhedsbreve
  • RSS-feed

Redaktør: Karin Christofferse
Nyheder redactor: Morten Nyberg

Kundeservice: Stig Ole Salomon,
Flemming Sørensen

Tel: +45 00 99 99 00
Fax: +45 00 99 99 01

© Copyright 2014 Einsten.net - All rights reserved.